بینامین نتانیاهو، در جریان مراسم نامگذاری یکی از تاسیسات هستهای این کشور به نام شیمون پرز گفت: «نیروهای امنیتی اسرائیل با قدرت تمام با تلاشهای ایران در پیاده سازی نیروهایش و انتقال سیستمهای پیشرفتۀ جنگی به سوریه برخورد خواهند کرد... هیچ توافقی میان سوریه و ایران، ما را متوقف نخواهد کرد.»
این تهدیدات پس از انتشار خبر توافق تهران و دمشق برای ادامۀ همکاریهای نظامی تکرار شد. وابسته نظامی ایران در سوریه روز سهشنبه اعلام کرد که مشاوران نظامی کشورش در چهارچوب یک توافقنامۀ همکاری دوجانبه پس از جنگ نیز در سوریه باقی خواهند ماند.
ییسرائیل کاتز، وزیر اطلاعات اسرائیل نیز اعلام کرد: «توافق بشار اسد و ایران، آزمونی برای اسرائیل است. واکنش ما روشن و صریح است. ما به ایران اجازه نخواهیم داد تا در سوریه حضور نظامی داشته باشد... ما در سوریه با تمام توان خود با هر هدف ایرانی که اسرائیل را تهدید کند همچنین اگر نیروی هوایی ارتش سوریه علیه ما وارد عمل شود، مقابله خواهیم کرد.»
اسرائیل از سال ۱۹۶۷ میلادی بخشی از خاک سوریه در بلندیهای جولان را به اشغال خود درآورد و از آن زمان تا کنون، دو کشور از لحاظ فنی در وضعیت جنگ به سر میبرند. تهران در جریان جنگ هفت ساله سوریه از مهمترین حامیان سیاسی و مالی و نظامی بشار اسد، محسوب میشد. نتانیاهو همواره بر این موضوع تاکید دارد که ایران بزرگترین تهدید برای کشورش است و بر همین اساس خواستار خروج نیروهای ایران از سوریه است.